章的情节展开而破灭这部电影有不少这类的情况出现。
    因为没有很好的把故事讲诉出来，它的票房自然就会差了。因此孟获这次在剧本上对细节描写的很仔细，提醒画师们不要走歪，保证这部电影把故事讲得顺畅而最终的成品也基本让孟获满意了它的质量。
    电影剧情由hong物小精灵水上竞赛开始，举办这场竞赛的正是传说之城奥多马雷，也就是电影标题中的水之都。
    在水上竞赛的时候，小智受到拉帝亚斯的帮助而遥遥领先，却因为走错了水道而失去了冠军。之后，在亚军罗西的邀请下，小智一行浏览了奥多马雷，并且听说了两只传说小精灵的传说。
    怪盗姐妹桑娜、莉安也来到了奥多马雷，她们用特殊的方法找到了拉帝欧斯和拉帝亚斯，并且试图捕捉它们。拉帝亚斯为了逃避捕捉变成了人类少女卡侬的摸样。然后机缘巧合被小智救了下来。
    小智救了拉帝亚斯之后又和她分散，他和小刚等人来到了奥多马雷的博物馆，了解了奥多马雷防御灾难的装置。在这里，小智看到了一个正在收拾画具的少女。好像是刚才救下来的少女，但她是另外一个人。
    小智并不知道这一点，他带着皮卡丘追了上去，然后在一个花园里发现了一些镶嵌
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