米亚重新融入神圣罗马帝国的领土后保持了很大的自治权。国会和新教教会继续发挥重要作用，波希米亚人在宗教和国家问题上与哈布斯堡人争吵，为了平息捷克独立的早期运动，皇帝鲁道夫二世选择了较小的邪恶，允许波西米亚自由实践新教，然而鲁道夫雄心勃勃的弟弟马可西亚米里安认为这是一个弱点，他设法在1612年驱逐鲁道夫，并在奥地利所有省份开始严格的反宗教改革。
    哈布斯堡家族是天主教徒，他们用宗教裁判所逼迫新教徒必须信天主教，16世纪30年代宗教改革后，加尔文所在的圣城又发生了政治革命，当时笼罩着一种恐怖气氛，人们普遍相信瘟疫是隐藏的投毒者散播的阴谋。
    后来这些投毒者就变成了巫师，所谓的宗教审判内容也从气候魔法变成诅咒人生病的黑魔法了。
    新教立国之后不断扩张，日内瓦变成了新教的罗马，而加尔文被称为“日内瓦的教皇”。
    为了阻止分裂势力活动，哈布斯堡家族这么做无可厚非，不过底层的平民不那么觉得，他们感觉这是一次迫害，哈布斯堡王朝在消除波希米亚血统中的贵族。
    在明斯特，那个被布拉格新教徒厌恶的马克西米利安大公却是被爱戴的，他在1618年因无法解释的突然死
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